Merpati Nusantara Airlines merupakan syarikat penerbangan Indonesia yang beroperasi dari tahun 1962 hingga 2014. Syarikat penerbangan tersebut beribu pejabat di Jakarta, Indonesia, dan dikenali kerana menyediakan penerbangan domestik dan antarabangsa di dalam negara. Merpati Nusantara Airlines memiliki pelbagai jenis kapal terbang, termasuk kapal terbang Boeing dan ATR.
Sepanjang wujudnya, syarikat penerbangan ini menghadapi kesukaran kewangan dan isu operasi yang menyebabkan penutupannya pada tahun 2014. Ia digantung kerana tidak dapat memenuhi piawaian keselamatan dan hutang yang meningkat. Walaupun telah cuba beberapa kerap untuk menghidupkan semula syarikat penerbangan ini, ia belum lagi melanjutkan operasinya sejak itu.